MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 57954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017544	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	386042348
2	NC_017544	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	386042348
3	NC_017544	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042348
4	NC_017544	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042348
5	NC_017544	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042348
6	NC_017544	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
7	NC_017544	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042348
8	NC_017544	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042348
9	NC_017544	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042348
10	NC_017544	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042348
11	NC_017544	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042348
12	NC_017544	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
13	NC_017544	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	386042348
14	NC_017544	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042348
15	NC_017544	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
16	NC_017544	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	386042348
17	NC_017544	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042348
18	NC_017544	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042348
19	NC_017544	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	386042348
20	NC_017544	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042348
21	NC_017544	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	386042348
22	NC_017544	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042348
23	NC_017544	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042348
24	NC_017544	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042348
25	NC_017544	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042348
26	NC_017544	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042348
27	NC_017544	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
28	NC_017544	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	386042348
29	NC_017544	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
30	NC_017544	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	386042348
31	NC_017544	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	386042348
32	NC_017544	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	386042348
33	NC_017544	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042348
34	NC_017544	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042348
35	NC_017544	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042348
36	NC_017544	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	386042348
37	NC_017544	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042348
38	NC_017544	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	386042348
39	NC_017544	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042349
40	NC_017544	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
41	NC_017544	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
42	NC_017544	AG	3	6	2073	2078	50 %	0 %	50 %	0 %	386042349
43	NC_017544	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042349
44	NC_017544	TCAA	2	8	2097	2104	50 %	25 %	0 %	25 %	386042349
45	NC_017544	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042349
46	NC_017544	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042349
47	NC_017544	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	386042349
48	NC_017544	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042349
49	NC_017544	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	386042349
50	NC_017544	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	386042349
51	NC_017544	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
52	NC_017544	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	386042349
53	NC_017544	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042349
54	NC_017544	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	386042349
55	NC_017544	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042349
56	NC_017544	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042349
57	NC_017544	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042349
58	NC_017544	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042349
59	NC_017544	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042349
60	NC_017544	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
61	NC_017544	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
62	NC_017544	ATG	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042350
63	NC_017544	ACA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042350
64	NC_017544	T	7	7	3162	3168	0 %	100 %	0 %	0 %	386042350
65	NC_017544	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042350
66	NC_017544	TTG	2	6	3234	3239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042350
67	NC_017544	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042350
68	NC_017544	T	7	7	3295	3301	0 %	100 %	0 %	0 %	386042350
69	NC_017544	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042350
70	NC_017544	GGT	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042350
71	NC_017544	T	6	6	3420	3425	0 %	100 %	0 %	0 %	386042350
72	NC_017544	ATT	2	6	3431	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042350
73	NC_017544	CTT	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042350
74	NC_017544	GAT	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042350
75	NC_017544	CTA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042350
76	NC_017544	ACC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042350
77	NC_017544	T	6	6	3658	3663	0 %	100 %	0 %	0 %	386042350
78	NC_017544	TGT	2	6	3667	3672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042350
79	NC_017544	GCT	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042350
80	NC_017544	TAA	2	6	3900	3905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042350
81	NC_017544	CGG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042350
82	NC_017544	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042350
83	NC_017544	TCC	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042350
84	NC_017544	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042350
85	NC_017544	TTA	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042350
86	NC_017544	TTTAT	2	10	4207	4216	20 %	80 %	0 %	0 %	386042350
87	NC_017544	TGT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042350
88	NC_017544	TTTGT	2	10	4328	4337	0 %	80 %	20 %	0 %	386042350
89	NC_017544	TGG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042350
90	NC_017544	A	7	7	4437	4443	100 %	0 %	0 %	0 %	386042350
91	NC_017544	CGA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042350
92	NC_017544	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042351
93	NC_017544	A	7	7	4621	4627	100 %	0 %	0 %	0 %	386042351
94	NC_017544	TGAT	2	8	4703	4710	25 %	50 %	25 %	0 %	386042351
95	NC_017544	TGG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042351
96	NC_017544	AACC	2	8	4977	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	386042352
97	NC_017544	TGCT	2	8	5003	5010	0 %	50 %	25 %	25 %	386042352
98	NC_017544	TAT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042352
99	NC_017544	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042352
100	NC_017544	ATTT	2	8	5302	5309	25 %	75 %	0 %	0 %	386042352
101	NC_017544	CAA	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042352
102	NC_017544	TTCA	2	8	5464	5471	25 %	50 %	0 %	25 %	386042352
103	NC_017544	GCG	2	6	5488	5493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042352
104	NC_017544	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042352
105	NC_017544	A	6	6	5603	5608	100 %	0 %	0 %	0 %	386042352
106	NC_017544	AATC	2	8	5612	5619	50 %	25 %	0 %	25 %	386042352
107	NC_017544	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042352
108	NC_017544	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042352
109	NC_017544	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042352
110	NC_017544	TTC	3	9	5801	5809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042352
111	NC_017544	GAT	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042352
112	NC_017544	CGA	2	6	5832	5837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042352
113	NC_017544	ACA	2	6	5896	5901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042352
114	NC_017544	CAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042352
115	NC_017544	A	7	7	5970	5976	100 %	0 %	0 %	0 %	386042352
116	NC_017544	AGA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042353
117	NC_017544	TTG	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042353
118	NC_017544	TGA	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
119	NC_017544	GAAATT	2	12	6232	6243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042353
120	NC_017544	A	6	6	6311	6316	100 %	0 %	0 %	0 %	386042353
121	NC_017544	GTC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042353
122	NC_017544	TGG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042353
123	NC_017544	GGC	3	9	6373	6381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042353
124	NC_017544	GTG	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042353
125	NC_017544	GTA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
126	NC_017544	GAA	2	6	6523	6528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042353
127	NC_017544	AAC	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042353
128	NC_017544	TCGTAC	2	12	6621	6632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386042353
129	NC_017544	GAA	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042353
130	NC_017544	TAAA	2	8	6752	6759	75 %	25 %	0 %	0 %	386042353
131	NC_017544	CCA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042353
132	NC_017544	ATTT	2	8	6787	6794	25 %	75 %	0 %	0 %	386042353
133	NC_017544	GAT	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
134	NC_017544	ATA	2	6	6839	6844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042353
135	NC_017544	CAT	2	6	6861	6866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042353
136	NC_017544	TTA	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042353
137	NC_017544	CG	3	6	6954	6959	0 %	0 %	50 %	50 %	386042353
138	NC_017544	TAA	2	6	6963	6968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042353
139	NC_017544	TGA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
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141	NC_017544	CAAAA	2	10	7074	7083	80 %	0 %	0 %	20 %	386042353
142	NC_017544	TAAA	2	8	7136	7143	75 %	25 %	0 %	0 %	386042353
143	NC_017544	ATG	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
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151	NC_017544	ATTA	2	8	7539	7546	50 %	50 %	0 %	0 %	386042353
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166	NC_017544	GCA	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042354
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173	NC_017544	CTG	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042354
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176	NC_017544	TTA	2	6	8844	8849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042354
177	NC_017544	GAA	2	6	8914	8919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042354
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256	NC_017544	TGA	2	6	12693	12698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042356
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258	NC_017544	AGT	2	6	13014	13019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042357
259	NC_017544	TTC	2	6	13056	13061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042357
260	NC_017544	T	7	7	13066	13072	0 %	100 %	0 %	0 %	386042357
261	NC_017544	GAT	2	6	13084	13089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042357
262	NC_017544	TGC	2	6	13215	13220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042357
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264	NC_017544	TA	3	6	13247	13252	50 %	50 %	0 %	0 %	386042357
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